Внешний снёс, сменил разметку на GPT, потом GParted откопировал раздел с ubuntu со стационарного жесткого на внешний, попытался установить туда граб, вылезла опять ошибка, отключил стационарный жесткий подключил внешний, запустился с Live, установил Boot Repair он нашёл кучу ошибок, выдавал много строк которые нужно было в консоль вбивать, но всётаки поставил на внешний граб. Теперь внешний везде запускается, и стационарный работает, вобщем всё как хотелось. Всем спасибо за советы, помогли.