Установил обычный CodeSys 2.3 из сайта 3S - заработала и версия от Eaton Xsoft.
Подключение по RS-485 не работает, когда-то проверял, для Ethernet нужно много костылей. Использую только в режиме эмуляции. Другой софт для конфигурирования ПЛК или регуляторов под Wine в большинстве случаев работает криво, потому бросил эти затеи. Для работы с железом лучше завести дешевый ноутбук с Windows.