можно восстановить отсюда
- точнее, там можно попробовать посмотреть откуда восстанавливать
... а вообще, то для начала следовало бы посмотреть выхлоп
ls "$HOME"
или
ls ~/
... и еще, причина может быть в "оптимизации" перечня запускаемых автоматически приложений и служб, например в MATE прописана в автозапуск процедура Обновление папок пользователя (Обновить имена общих папок для соответствия текущему языку), если её отключить, то в некоторых случаях можно получить то, что сейчас наблюдает у себя ТС