Boot-Up Manager пробовали?
Ну, для отключения демонов я предпочитаю по старинке sysv-rc-conf (привычнее)
Вот только, у меня есть сомнения, что отключив запуск демона, я отключу саму железяку.
Хотелось бы просто попробовать отключить запуск апплета и посмотреть, будет ли blueman запоминать состояние.
Причем, как я понимаю, апплет должен запускаться от имени пользователя в его сеансе, или нет? Ранее, по-моему, апплеты, при исключии их из автозапуска пользователя, не грузились. Сейчас этот номер не прокатывает - такое впечатление, что апплет грузится глобально.
Да и мне не критично - пусть бы был и стандартный апплет, лишь бы состояние запоминал. А то обидно - апплет сети состояние вайфая запоминает, а апплет синезуба - нет