coder-ex, так уж вышло, что я довольно много всяких облачных решений перепробовал (MEGA, Yandex, Google, SpiderOak, Dropbox, OneDrive, Nextcloud и "персональное облако" SyncThing), и ни в одном нет такой настройки (на сколько я помню).
Есть настройки версионирования (в некоторых из перечисленных выше), т.е. возможность вытащить старую или альтернативную версию файла. Но версионирование все равно не дает настроек включающих интерактивное взаимодействие с системой в процессе синхронизации. Все эти решения именно на то и нацелены, что бы решать всякого рода конфликты автоматически.
Синхронизация с облаком тем и хороша, что не требует никакого внимания к самому процессу синхронизации. Т.е. вы один раз настроили и забыли, просто пользуетесь благами.