При работе по сете мне присылают файлы и кидают на флешки
Так присылают или кидают? То есть, в конечном варианте вам отдают на флэшке, которая не является вашей собственность и запись на которую вы не контролируете?
Если так, то несколько вопросов:
1) Какая файловая система на флэшке?
2) Стал ли недавно человек, что передаёт вам флэшки, или те люди, что присылают файлы, пользоваться Linux-системами?
3) Меняли ли вы недавно права на какие-нибудь каталоги в своей системе?
4) Какого типа файл?