насчет загрузочной партиции - не нужно этого. для того груб и прописывается в мбр. из мбр запущается код, который находит на харде сам загрузчик. в этом еще одно отличие grub2 от старого груба. так что флаг "boot" на партиции не важен, прекрасно ставится без него.