с-с-с...не очень ясно...
то есть тебе приходится после каждой загрузки машины еще раз перезапускать Иксы, чтобы заработала клавиатура?
Где-то с выкладывал клавоглюкоустрансющий скрипт, иногда помогает...
Попробуй вот что:
sudo kate /usr/bin/keyb_ru
Туда запихай:
#!/bin/bash
xprop -root -f _XKB_RULES_NAMES 8s -set _XKB_RULES_NAMES xorg
setxkbmap -layout 'us,ru(winkeys)' -option 'compose:rwin,grp:alt_shift_toggle,grp_led:scroll' -model pc105
Затем сделай
sudo chmod +x /usr/bin/keyb_ru
sudo chmod 777 /usr/bin/keyb_ru
После чего добавь эту историю в автозапуск. Может быть, поможет.