не уверен что поможет но может стоит посмотреть как стартуют иксы под рутом.
с GDM внизу (точно не помню) рядом с выбором сессии есть настройки. По умолчанию там руту в графике запрещено, так вот нужно убрать галку, потом имя root пароль рутовый... если проблема в хомяке то все стартанет.