Пробовали сохранять и восстанвливать настройки?
Оба действия с помощью /usr/sbin/alsactl, надо правильно указывать номер карты.
В alsamixer нажали F5, настроили, вышли, с помощью alsactl сохранили в файл,
потом при входе ею же восстанавливаете. Кажется, у неё нумерация с нуля.