Если нечего сказать - не стыдно промолчать.
Ванги умерла, причём давно, и если гугл молчит на запросы типа
"в убунте отключается левый шифт",
"в убунте отключаются кнопки клавиатуры" и пр.
то значит трабла (если она конечно есть) - уникальный результат сложения многих факторов, и не носит массовый характер, поэтому готового решения нет.
Чтобы найти решение - вспоминаем, что Ванга умерла, и пытаемся отловить проблему, благо на триггер появления проблемы ты сам и указал.
1) запусти N консолей, где N ≥ 2, в первой консоли выполни
tail -f /var/log/syslog
во второй
tail -f /var/log/dmesg
в остальных - логи (при наличии) freecad, или любые другие, имеющие намёк на "xkb" или "kb" в названии
2) запускай freecad и "что-то в ней делай"
и смотри там все ошибки.
Если логов будет вагон и маленькая тележка, то можно сузить поиск чем-то вроде:
tail -f /var/log/syslog | grep error {или grep key или grep xkb}