Я так понимаю что он или не видит его или нужно еще что то до настроить.
Проверте из командной строки подключение к репу
Можно ли у ssh агента задать настройки по умолчанию, чтобы не спрашивался каждый раз пароль?
Используйте ключ шифрования для подключения
А как это использовать ключ шифрования?
Подключение к репозиторию есть из командной строки, если предварительно для программы ssh агент выполнить команду
ssh add
и ввести пароль для ключа SSH.
Либо передавать переменную окружения например
SSH_AUTH_SOCK=$SSH_AUTH_SOCK.
Но gitKraken запускается по клику на иконку, как тогда задать переменную окружения?