Изменения в файловой системе при использовании спящего режима не сохраняются на диск, а остаются висеть в памяти (в файле восстановления из сна). При загрузке в другую ось, эти изменения недоступны. Более того, изменения в файловой системе другой операционной системы игнорируются при выходе из сна, так как служебная информация загружается из файла состояния (памяти). Таким образом, легко привести файловую систему в нерабочее состояние.
Пример.
Допустим, есть некоторый файл. Удаяем этот файл. Уходим в этой оси в сон, грузим другую. В другой оси файл как бы присутствует! И мы его даже открыть сможем, так как удаление физически данных файла не происходит при удалении.
Дальше - больше.
Создаём в одной оси файл, усыпляем ось, грузим вторую. Во второй оси его нет! Создаём другой файл - с некоторой вероятностью, он может лечь на те данные, которые соответствуют созданному до усыпления файлу. Возвращаемся после этого в усыплённую ось - файл есть, но содержимое-то от другого файла! Файловая система покорёжена...
http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A1%D0%BF%D1%8F%D1%89%D0%B8%D0%B9_%D1%80%D0%B5%D0%B6%D0%B8%D0%BC