Спецы нужна прога чтобы копировала данные сразу по файлам , а не создавала названия папок и лишь затем копировала данные, Копирование винта на винт, копирование не постоянное, выключать комп на некоторое время, и подключать друге винты (на которых стоит Windows например)
Копирование в убунте, можно копировать из терминала и т.д. (опишите подробнее как именно лучше копировать)