Mascarpone,
Вопрос поставлен не верно. Ядра приходят уже в собранном виде.
У вас под новое ядро видимо не собирается модуль драйвера Nvidia.
Я, надо сказать, так и не понял как вы драйвер ставили. Если поставить не правильно, то вот именно так и должно происходить.