Я делал так:
1) Удалил всё с флэшки командой
sudo rm -r ... , где ... - как примонтировалась флешка, у меня было sdc. (Будбте осторожны, иначе сотрёте то, что не нужно)
2) Отформатировал в FAT , после чего стал виден правильный обьём флэшки и стало возможно на неё записывать.