Сожалею, но по моей практике задача удаления этой панели в Unity не выполнима.
Сам использую два монитора. Наверное, на втором мониторе она мешает лишь дублем с первым.
Проще в Lxde. Там панель задач сидит на главном мониторе, не переходя на второй. Но также имеются свои проблемы, из-за которых мне приходится считаться с этим дублем верхней панели на втором мониторе.
Скажем так, это не критичная проблема. Этакий компромисс.