freedomslaves, о таком способе мне не известно (разве что восстановить из заранее сделанной резервной копии). Тут главное, что важного у вас в Ubuntu. Где хранятся пользовательские данные? На отдельном "D", не являющимся системным (и, скорее всего, в NTFS, что бы виделось с двух систем), или в "Домашней папке"? А "Домашняя папка" на отдельном разделе (/home) или на системном /?
А за Windows не беспокойтесь, при установке 16.04 снова поставиться Grub и подхватит обе системы.