Проверил все файлы на флешке через md5sum - все корректно.
Можешь показать как это сделал? Не на словах сказать "я проверил, там все правильно", а последовательно показать действия, чтобы здесь - на форуме было видно.
dd bs=4M if=ubuntu.iso of=/dev/sdb
if=ubuntu.iso это такой полный путь к файлу?
================================================
То есть я считаю, что ничего ты на флешку не записал, поэтому и не находит ОС. А проверил, да еще и "все файлы" ты не на флешке, а на исходном образе.
Так это или нет, будет видно после того, как дашь ответы на заданные выше вопросы.