ITicDigger, как бы это сейчас не прозвучало странным, но для начала можно порекомендовать отключение системной службы поиска baloo.
В мониторе системном такого процесса не увидел, sudo systemctl status baloo ничего не выдал, systemctl list-units --type service --state running тоже не выдал ни одной строчки с ним, systemctl list-units --type service -all тоже его не выдаёт. Думаю он не запущен.
Тут надо отметить, что сразу после установки я зашёл в настройки - поиск файлов и снял галку "включить службу поиска файлов (она по прежнему снята), причём всё проблемные тома (с NTFS) как то сами добавились в список "Исключить следующие папки из поиска", так что с этим проблем быть не должно. Единственный намёк на поиск остался в настройках - управлении службами - это включённая служба "Обновление папок поиска".
Установил Krusader - он тупит не хуже Dolphin при смонтированных NTFS-разделах.