В общем тут оказывается, дело не в Ubuntu
Были сегодня в офисе, где временно находится сервер.
Оказалось, что к программному обеспечению это не имеет никакого отношения.
Мы проверили все кабели, коммутаторы, нет ли механических повреждений в RJ-45 разъёмах. Всё оказалось в порядке.
У сервера две сетевые карты. Так вот пробовали переставить кабель в соседнюю сетевую карту, так она вообще не включилась.
Потом перенесли сервер в другую комнату, к другому кабелю, там другой коммутатор. Включили сервер, так вот на том месте наоборот, вторая сетевая карта заработала, а первая нет. После этого кабель питания в розетке перевернули, и после этого наоборот, первая сетевая карта заработала, а вторая нет.
Вероятно это какая-то особенность блока питания, что ему не всё равно как вставить кабель в розетку, с какой стороны фаза а с какой стороны ноль.
Возможно, как предположение, в офисе у розеток нет заземления, это и повлияло на такое поведение блока питания.