Не знаю что можно было такого запилить в новое ядро 3.2.0-24, но именно с ним pidgin категорически отказывается появляться в трее Unity. Не помогают никакие извращения с задержками и "вайтлистами". Пока откатился на старый имейдж ядра, но это уже начинает понемногу выбешивать. Как собственно и прошлый баг в 11.10 с тем же pidgin, когда пропадал значок при определенных обстоятельствах.
//12.04, amd64