Столкнулся с аналогичной проблемой. Выдавал сообщение о необходимости перезапуска compiz. В Гном 3 после входа был виден только рабочий стол и мышка, без верхней панели. Нормально работал только Гном classic без эффектов. Ну и Юнити, если не считать сообщений об ошибках Compiz.
Решилось откатом драйвера до 295.33:
sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-x-swat/x-updates
sudo apt-get update
sudo apt-get install nvidia-current=295.33-0ubuntu1~precise~xup1
В "параметрах системы"->"драйверы устройств" должна быть активированна "current"-версия драйвера.
После перезагрузки всё действительно заработало.