и ничего кроме системы на С не должно быть
В Windows? Я Вас умоляю! А "Мои документы" по-умолчанию где лежат? (C:\Documents and settings\...; C:\Users\...). По-умолчанию и Ubuntu и Windows устанавливаются именно что в один диск. Только в случае с Windows это "гвоздями приколочено", и если "Мои документы" в старой доброй XP перемещались относительно безболезненно, то в Windows 7 с внедрением "библиотек" как это сделать - уже не так очевидно (дальше 7 я не знаю, - не видел толком систему). Кроме того, "на цемент" посажено положение того же "Рабочего стола", - его местоположение Вы при всем желании не поменяете, он так и останется на C:\ [особенно весело, когда люди туда фильмы на полном серьезе бросали, а после спрашивали: "а чего он у меня на нехватку места ругается, у меня же диск террабайт?" (из террабайта на поверку системе оказывалось отдано 50 Гб, из которых она реально ела 30, а еще 20 было забито содержимым рабочего стола)].