Iskatel-X, а что мешает поставить вручную по отдельности Apache, MySQL, PHP ? На losst есть хорошая статья. Сам недавно ставил по ней - все четко (пара нюансов из-за устаревания статьи было, но решить их не сложно).
И не ясно, что имеется в виду под "нет входа в систему, только консоль сервера". В какую систему? Консоль сервера - это по вашему терминал Ubuntu?