что-то я не понял что Вы хотите...
ntpdate ntp.ubuntu.com
вот вам синхронизация
Насколько я знаю время операционной системы и время BIOS различаются. Или на серверах это не так?
Смотря что ты имеешь ввиду, где-то в убунте должен быть параметр
UTC=yes - ОС считает время BIOS по Гринвичу и + часовой пояс
UTC=no, тогда ОС работает по времени биоса
А если мы руками решим поставить время например через утилиту data изменения в биос запишутся по команде
clock -w
хотя сохранение времени может быть прописано в init.d при выключении
А если использовать NTP сервис для синхорнизации, то он делает поправку к времени биос в ОС, но не сам не изменяет значения в биосе
Вот тебе и разница