Ну... Для приобретения навыка я бы предложил ещё раз собрать ядро и заголовки по How-To коммьюнити )))
Как-то мне пока не приходилось экспериментировать с ядром и заголовками, собранными разными способами, наверное, ради эксперимента можно попробовать, но для подстраховки надо бы пересобрать единообрАзно. Дрова встанут без проблем, я думаю. Я использую дрова NVidia, которые вышли задолго до 2.6.24, причём и на простом ядре и на rt1, и никаких проблем не испытываю.