Это связано либо с кривой разметкой диска изначально, либо с динамическими разделами для винды.
Я лично с такой штукой не сталкивался, так как рядом не ставлю. Разумеется, если все с начала сделать правильно, то будет все видеть.
То есть создать новую таблицу разделов, постаить винду, поставить ubuntu. Как сделать проще не знаю.