Прежде всего, желательно пробскапить данные. Если винт побит физически, то случиться может все, что угодно. Потом выполнить следующие команды:
sudo init 1
(ввести пароль админа)
fsck /dev/ИМЯ_РНЗДЕЛН
(пофиксить все, что выйдет)
reboot
У меня как-то физически портился диск (пошел весь бсдами), так Ubuntu на нем работала еще 2 недели, даже при условии того, что при любой перезагрузке fsck шел более часа. Но данные скопировались, не удалось вытснуть только около 10% данных, хотя бсдов было порядка 20%. Система постоснно пыталась блокировать бсды и побилось только то. что было в бсдах на момент их появления.