У меня тоже проблемма с проверкой раздач - т.е. некоторые раздачи проверяются, некоторые - нет.
С отдачей у меня всё нормально, раздаёт по максимуму.
Проблеммы с проверкой раздач появились несколько месяцев назад, после очередного обновления Deluge (этим торрент-клиентом пользуюсь уже более года). Сейчас, правда, вышло очередное обновление, вроде 2.0, надо пробовать обновить, может глюк исчезнет.
З.Ы. И да, раздачи лежат на НТФС-разделе.
З.З.Ы. К топиксатартеру - а Вы проверяли порт через который идут раздачи? Может он у Вас закрыт?