В итоге решил проблему с помощью двух ide дисков и двух flash-накопителей, а также частичной чисткой. Вся инфа на диски естественно не влезла, но зато сократил свои действия до минимума. Но неприятности, пусть и мизерные, остались.
Вычитал где-то, что раздел своп желательно делать первым на первом диске, и если позволяет место размером с две оперативы (с запасом), у меня оперы 3 гиббона, поэтому не пожалел для свопа 6Гб (с небольшим плюсом). Оттуда же вычитал, что все разделы желательно делать первичными (не помню как точно это называется), если этих разделов не больше четырёх. Всё оставшееся место на первом 80Гб диске отдал корню (то бишь сама система). С помощью gparted сжал в конце второго торобайтного ntfs, начало (чуть больше половины всего объёма) отформатировал под ext4. Отключил шлейф ide перед установкой (а то эти диски отображались перед sata, мало ли чего), и после установки перекинул с ntfs всё в /home (в начале торобайтника который). Следующим шагом был выход с livecd и с помощью всё того же gparted удаление ntfs и расширение до полного объёма диска раздела ext4. После очередной переустановки системы подключил ide и флешки и наконец вернул всё на родину (впоследствии убрав уже не нужные ide из компа).
И вот всё вроде бы отлично, но папки в разделе /home стали открываться не мгновенно, как было всегда, а спустя секунду-две. Это не может быть глюк наутилуса, потому что остальные папки из корневого раздела открываются нормально. Была даже бредовая идея, что раньше в домашней папке практически ничего не было, поэтому "читать" там было нечего, а щас инфы довольно много. Но это по-моему полнейший бред. Проблема конечно, не проблема, но решить её всё же хотелось бы...