Не смотря на то, что это не является прямым решением проблемы, все дело в том, что значки в трее морально устарели, и это абсолютно не то, что стоит использовать. Вайбер работает если закрепить его в док. При повторном клике по иконке он восстановит окно. С облагом, прости меня господь, мейлру должно быть так же.
Больше порекомендовать ничего не могу, создайте багрепорт, ждите фикса, ибо это явный баг.