в /etc/fstab закомментировать строчку с виндовым диском, как вариант, тогда не будет видно. в gparted (или любой другой программе по работе с разделами) раздел размонтировать, клик правой кнопкой - управление флагами - галочка на "hidden". теперь его нигде не видно))