А так?
В Thunar`е идём Переход/Открыть адрес и вставляем в адресную строку
davs://webdav.yandex.ru/
Имя пользователя и пароль указываем свои, яндексовские.
Можно поставить радиобутон на "Запомнить навсегда" и внести папку в закладки Тунара (безопасно это или не очень пусть каждый думает сам:))