при установке Ubuntu по стандарту папка /home будет тоже размещена на этом диске, а значит что месть под музыку и фильмы будет уходить с SSD...
Т.е. вы не поняли ничего.
Как ни странно, ответ точно такой-же, как и по playonlinux. Каталоги Downloads, Documents, Videos и т.п. заменяешь симлинками, указывающими на реальное расположение этих каталогов.
Они могут быть как на одном разделе, так и на разных дисках-разделах. Т.е. реально данные будут находится на другом диске и соответственно, место будут занимать там.
Все настройки и данные, могущие повлиять на загрузку системы, будут находится на системном разделе. Не возникнет проблем с загрузкой системы, если по какой-то причине не смонтируется другой диск-раздел.
И бэкап системы проще сделать, когда все в одном разделе. И эффективнее им пользоваться.
В принципе и Desktop можно заменить симлинком, но я не советую этого делать.
Можно применить и более продинутый вариант. Монтировать медийные каталоги с помощью оверлейных файловых систем.