Можно использовать Glade, а можно и нет... Там разные типы проектов.
А вообще надо курить layout'ы, или контейнеры в терминологии гтк. Для того, чтобы разместить слементы управления фиксировано, надо использовать контейнер Fixed:
Fixed fixedBox = new Fixed();
Label lbMessage = new Label("Message:");
fixedBox.Put(lbMessage, 10, 20);
Но вообще лучше использовать контейнеры с не фиксированным размещением фиджетом, например VBox или HBox и еще что-нибудь.