Знаю, что работать с семплами в wav (а также ogg и возможно ещё другими форматами звука) умеет встроенный в секвенсор LMMS модуль AudioFileProcessor. Правда, разумеется, его никак не запихнуть в Ardour, на Ardour лучше использовать в качестве сводилки, записав все инструментальные дорожки заранее.