Kiborg_Man, что Вы имеете в виду под "падением" caja? Сымитируем ситуацию:
1. У Вас открыто окно caja. В окне открыта флешка. Вы эту флешку извлекаете, и у Вас закрывается при этом данное открытое окно (больше ничего не происходит, на рабочем столе видны значки, повторный запуск caja приводит к открытию еще одного окна, - все как обычно).
2. У Вас открыто окно caja. В окне открыта флешка. Вы эту флешку извлекаете, и у Вас закрывается окно, а на рабочем столе перестают отображаться значки, и только через некоторое время все восстанавливается (или восстанавливается только при повторном вызове caja любым из доступных способов)
3. У Вас открыто окно caja. В окне открыт не тот каталог, который потеряется при извлечении флешки (например, /home/). Вы извлекаете флешку, и окно закрывается. Кроме того, при этом пропадают значки с рабочего стола, и только через некоторое время все восстанавливается (или восстанавливается только при повторном вызове caja любым из доступных способов)
4. (иной вариант - опишите какой именно)
Какой из вариантов наиболее соответствует происходящим у Вас событиям?
Если caja запустить из терминала, и выполнить такое же извлечение флешки - что будет написано в терминале перед падением caja?
Сразу говорю, что ничего страшного в поведении, описанном в п.1 нет, - так и должно быть, насколько я понимаю.