smartmontools - набор утилит для проверки и мониторинга жизненно-важных параметров накопителей с помощью SMART.
Все производители рекомендуют оставлять примерно 10% диска нетронутыми, то-есть оставьте неразмеченными 10 гиг. Остальное: 20 гиг - под корень системы, остальное - под /home.
/home в отдельный раздел имеет смысл выносить, чтобы в случае чего спокойно снести систему, оставив раздел /home, не боясь потерять настройки системы и программ, а также личные данные.
Swap лучше вынести на HDD, если есть, а если нет, то сделайте небольшой, метров на 500, чтобы сильно не дёргать SSD в случае свопинга.
Настройте swappiness в как можно меньшее значение, лучше в ноль, чтобы своп использовался как можно реже, например - никогда. И оперативы побольше установите.
P.S. О, тут уже всё написали. Торможу.