Вот ты тоже, вроде написал не мало. Но не написал нужного.
Начать с того, какая у тебя система. dconf-editor в версии 16 и 18 отличаются, как небо и земля.
в меню слева просто нет такого огромного дерева меню
В версии 18 вообще нет меню слева, единое пространство на все окно.
Количество пунктов в dconf зависит от количества программ. Не все программы хранят настойки в этой базе. В основном это гном-программы.
Например у меня в корне всего восемь пунктов, В двух находится всего по одной программе (indicator-multiload, gnome-mpv). В третьем настройки самого dconf-editor.
почему у меня нет пунтов в меню
Чего конкретно вам не хватает.
Сейчас посмотрел.
Kubuntu 17 - один пункт: /org.
Xubuntu 18 - четыре пункта: /apps, /ca, /com, /org.
Неудивительно. И та и другая хранят свои настройки каждая в своих файлах.