Ох. В /usr может копировать только root и лучше это не менять ибо тебе в /usr обычно делать нечего. А чтобы всё скопировалось, нажми Alt+F2, набери там gksu nautilus и копируй сколько хочешь, но очень аккуратно))) Но вообще советую до просветления почитать про организацию доступа к данным в Linux, т.е. про пользователей, группы и права доступа и главное, зачем всё это нужно. Мне лично очень редко надо что-то скопировать туда, куда у меня нет доступа. Специально так сделано.