SantyagoS,
А зачем отключать, чтоб потом включать?
А виртуальный сервер у вас где и какой?
На десктопе поднимать сервер - моветон. Если хочется, то создайте виртуалку (c
vagrant удобно - висит в фоне, по ssh подключается, порты прокидывать одна
радость), чтоб не засорять систему.
Скрипт будет состоять из пары строк -
service nginx start
service mysql start
etc
Что касается отключения при автостарте - нужно смотреть инит скрипты и отключать.