кроме apt-get purge или aptitude purge полностью вычитстить можно к только ручками проходясь по списку файлов находящихся в пакете.
Команда apt(itude/-get) remove вычищает все файлы, которые есть в пакете, кроме тех, что находятся в /etc. Команда apt(itude/-get) purge вычищает все без исключения файлы, которые идут в пакете, в т.ч. и все, что лежат в /etc. Те файлы, которые создаются в результате работы программы (кеши, базы данных и т.п., обычно это всё в /var) должны чиститься с помощью post-remove скриптов, которые идут вместе с пакетом. Прикладные программы (не демоны) обычно создают файлы в хомяке пользователя и как правило не вычищаются при удалении программы. А там, обычно в скрытой папке, имя которой начинается с точки и названием программы, хранятся пользовательские параметры.
Пользователь решил продолжить мысль 23 Мая 2010, 18:06:52:
старые конфиги возможно не удалились из-за зависимостей к которым purge не был применен.
Такое невозможно, в пакетном менеджере на уровне файлов зависимостей не существуют, только на уровне пакетов.