У меня с этой проблемой в Kubuntu однажды помог такой манёвр, пометку себе про это сделал такую.
##SKYPE просит при каждом запуске авторизацию
Установить программу Пароли и ключи (Seahorse)
удалить ключи из
/home/stdds/.local/share/keyrings
Перезапустить скайп и на предложение завести пару ключей оставить поля пустыми и продолжить, после этого скайп запускается не запрашивая пароль