Итак. Проблему частично решил так:
Так как у меня был доступ к терминалу, я создал нового пользователя. Потом поставил gnome через консоль, но это для убунты, а у меня mint, временный вариант, чтобы просто была DE. Так как этот гном для убунты, хотя разница мала, но все равно, либо я какие-то пакеты не докачал, либо реально конфликт DE с ОСью и поэтому не много коряво тут все работает.
Все пароли из KeePass мне так и не удалось достать, т.к. файл БД для него лежал в каталоге юзера, у которого и стерся домашний раздел. (моя глупость), благо все аккаунты привязаны к телефону, все восстановлю.
Теперь вопрос в другом, как мне сейчас можно полностью стереть xfce и гном, и заново поставить xfce?
Место на диске не так много, поэтому желательно вообще полностью стереть все DE.