Вы мне назовите версию убунты где в русскоязычной раскладке работают хоткеи например VLC? Знаю что не работает с 12.04 точно, а может и раньше не работало. Я к тому что это не тот баг который на вас внезапно свалился, всё началось давно рушиться. Пока не дошло до уже критического момента и не замечать было не возможно, а чиниться всё костылями. У меня вот терминал стал открываться хоткеем в русской раскладке, видимо костылек в обновлениях пришёл, но ведь это исправление не касается всего остального. так вот и латают каждое приложение, и обязательно будет что то, что не работает в раскладке отличной от английской - такие дела...