Сочувствую вашему горю.
С другой стороны, щас помещу эту тему в закладки и буду на этом форуме подсовывать каждому, кто катит на меня бочку, когда я пропагандирую использовать вменяемые фс типа XFS вместо архаичного хлама Ext3(4). 
Цитата со ссылки в первом сообщении:
Подобные проблемы с потерей пересоздаваемых перед крахом файлов также свойственны таким файловым системам как XFS и Btrfs.
Вопрос, который остался для меня загадкой - если крах системы произошел во время, когда в журнале есть данные, а в область данных еще данные не занесены, то ИМХО такую проблемму нормальная журналируемая ФС должна корректно отработать и вернуться к старой версии файлов (проигнорировав метаданные в журнале). Или я чего-то не допонимаю...
Тут давеча тестировал XFS - жестко выдерая USB шнурок внешнего харда во время записи на диск в несколько потоков - ни разу нулевых файлов получить не удалось - файл либо есть, либо его нет. Есть подозрения что всеже это глюк именно EXT4....