Увидел что в error появляется mod_python, хотя я его не использую. Я его удалил, апач рестартнул, покачто не падает. Сейчас меня ддосили 1500 ботов, сайт немного тормозил, но не упал. На Intel Core 2 DUO E8200 (2.66 ghz, 6mb cache).
Я думал что ктото его ложит когда меня нет. Оказалось дело не в этом, а что может быть с конфигом?