Можно посмотреть скриншот с обоих систем при одинаковых настройках монитора?
Только сначала сбросьте в обоих системах настройки видеокарты на "Дефолт". Тоже сделайте и с настройками самого монитора. Потом на монитор поставьте контрасность 50% (и яркость желательно тоже 50% - для чистоты эксперемента), а в цветовых настройках монитора выберите
режим s-RGB (настройки контрастаности и яркости могут стать недоступны - зависит от производителя монитора)
или предустановку цветовой температуры
в 6500K, так же поставьте режим "Нормальный" (где "Кино", "Текст" и т.д.) и отключите в мониторе все системы сохранения электроэнергии и изменения яркости от внешнего совещенния.
Дальше можно настраивать по интернет-тесту:
http://www.lagom.nl/lcd-test/Впрочем, можно сохранить всю страницу на компьютер и все тесты будут окрываться локально в интернет-браузере.
Контраст оставьте на 50%, а яркость варьируйте так, что бы на странице
http://www.lagom.nl/lcd-test/white.phpв поле 254 - квадратов не было видно, в поле 253 - они казались видимыми (на грани сознания: "то ли - есть,то ли - нет"), на поле 252 - были уже более-менее различимы.
При этом на странице
http://www.lagom.nl/lcd-test/black.php, та же ситуация должна быть с чёрными полями, но поскольку матрица вашего монитора не предназначена для точного отбражения оттенков, то, скорее всего, первые 5-8 полей будут неразличимы. Попытка высветлить их, увеличивая яркость монитора, приведёт к искажениям в тесте на белых поля и излишнему пересвету. Я бы предпочёл провал в тенях, но хорошую передачу светов.
Добившись более-менее приличноё картинки, можно дополнительно покрутить контрастность - для улучшения результата.
Если при включени режима s-RGB, регулировка яркости или контрастности (или обоих параметров вместе) станет недоступной - не расстраивайтесь - это задумка производителя - ему виднее. Оставьте как есть.
А если цвет покажется немного жёлтым - привыкайте, через два дня вы будете считать его белым.

Ну и напоследок, после всего перечисленного, хорошо бы купить калибратор (4000 - 6000 руб.) и аппаратно откалибровать монитор. В Windows для этого нужно будет установить программу и драйвера с прилагаемого диска, а в Ubuntu драйвера уже есть в ядре системы, а программа настройки встроена в "Параметры системы"/"Цвет". Правда, она в 12.10 поломана, а в 12.04 работает прекрано,но только в Unuty и в GnomeShell (в KDE может не заработать).
Программа создаст профиль Вашего монитора, который при загрузке системы будет автоматически применяться в утилите управления видеокартой.
В довершение, во всех программах, где возможно (особенно в тех, что работают с фото) пропишите в настройках "использовать системыный профиль" или впрямую укажите путь до только-что сгенерированного профиля.
К сожалению, Ваш монитор не рассчитан на точное отображение оттенков (это по силам только IPS-матрице), но ручная, и тем более, аппаратная калибровка, улучшит результат. Более того, если, по какой-то причине, Windows и Ubuntu всё же будут показывать разные цвета после ручной настройки монитора, то калибратор автоматически учтёт расхождения и внедрит в видео-карту разные профили для разных ОС, приводящие к одинаковому результату - идентичным цветам на конкретном мониторе из любой ОС.