Обычно - делают так: через htaccess + rewrite перенаправляют все запросы к файлам на скрипт который считает статистику и отдает файл (пользователю это перенаправление не видно, т.е. в строке адреса все так-же прямой урл)
Если надо оставить как есть, именно прямое обращение к файлам - то только системными вещами.